ผู้เชี่ยวชาญเชื่อว่าการแพร่กระจายของโคโรนาไวรัสสายพันธุ์ใหม่ในแอฟริกามีส่วนทำให้ทั้งผู้ป่วยและผู้เสียชีวิตเพิ่มขึ้นทั่วทั้งทวีป จนถึงขณะนี้มีประเทศอย่างน้อยหนึ่งโหลที่ยืนยันว่ามีการตรวจพบตัวแปรนี้เป็นครั้งแรกในอินเดียเมื่อปลายปีที่แล้ว แต่มีความกังวลว่าไม่สามารถติดตามรูปแบบใหม่ได้อย่างง่ายดายเนื่องจากการทดสอบที่จำเป็นเพื่อระบุไม่สามารถใช้งานได้ในวงกว้าง

คลื่นลูกใหม่ของการติดเชื้อในแอฟริกาเชื่อกันว่าส่วนหนึ่งเกี่ยวข้องกับการเกิดขึ้นของสายพันธุ์บางอย่างที่สามารถแพร่เชื้อได้มากกว่า ยูกันดาเป็นประเทศแรกในทวีปที่ยืนยันการมีอยู่ของตัวแปรที่ระบุครั้งแรกในอินเดียเมื่อปลายปีที่แล้ว ขณะนี้มีรายงานตัวแปรนี้ในเคนยาโมร็อกโกแอลจีเรียแอฟริกาใต้บอตสวานาแองโกลาดีอาร์คองโกไนจีเรียยูกันดาแซมเบียและซิมบับเว